Funkcie a funkcie Tata Box

Ten Tata box, V bunkovej biológii je to konsenzuálna sekvencia DNA, ktorá sa nachádza vo všetkých líniách živých organizmov a je široko zachovaná. Sekvencia je 5'-tataaa-3 'a môže sledovať niektoré opakované adeníny.

Umiestnenie krabice je nad (alebo riekou nad, ako sa zvyčajne volá v literatúre) na začiatku prepisu. Nachádza sa v promótore génov, kde dôjde k spojeniu s transkripčnými faktormi. Okrem týchto faktorov sa RNA polymeráza II zvyčajne spája s krabicou Tata.

RNA polymeráza II. Zdroj: Fvasconcellos 21:15, 14. novembra 2007 (UTC) [verejná doména]

Aj keď je krabica Tata hlavnou sekvenciou promótora, existujú gény, ktoré ju chýbajú.

[TOC]

Charakteristika

Začiatok syntézy RNA vyžaduje, aby RNA polymeráza bola zjednotená špecifickými sekvenciami DNA, nazývaných promótory. Tata CAJA je konsenzuálna sekvencia promótora. Nazýva sa pribiew box v prokaryotoch a Goldberg-Hogness Box v eukaryotoch.

Tata box je región zachovaný v DNA. Sekvenovanie mnohých oblastí začiatku transkripcie DNA ukázalo, že konsenzuálna sekvencia alebo spoločná sekvencia je (5ʾ) t*a*taat*(3ʾ). Pozície označené hviezdičkou majú vysokú homológiu. Posledné zvyšky T sú vždy v promótoroch A. coli.

Umiestnenie boxu Tata v prokariotách

Konvenciou sú páry báz, ktoré zodpovedajú začiatku syntézy molekuly RNA, kladné čísla a páry báz, ktoré predchádzajú začiatku RNA. Tata box je v regióne -10.

Môže vám slúžiť: erytroblasty: čo sú erytropoéza, súvisiace patológie

V A. coli, Región promótora je medzi pozíciami -70 a +30. V tejto oblasti je v polohe -35 druhá konsenzuálna sekvencia (5ʾ) T*TG*ACA (3ʾ). Podobne aj pozície označené hviezdičkou majú vysokú homológiu.

Umiestnenie boxu Tata v eukaryotoch

V eukaryotoch majú podporujúce regióny signálne prvky, ktoré sa líšia pre každú z polymerázovej RNA. V A. coli Jedna polymerázová RNA identifikuje signálne prvky v oblasti promótora.

Okrem toho sú v eukaryotoch propagujúce regióny rozšírenejšie. V regióne -30 a -100 sa nachádzajú rôzne sekvencie, ktoré vytvárajú rôzne kombinácie v rôznych promótoroch.

V eukaryotoch existuje veľa transkripčných faktorov, ktoré interagujú s promótormi. Napríklad faktor TFIID sa viaže na sekvenciu TATA. Na druhej strane sú gény ribozomálnych RNA štruktúrované vo forme viacerých génov, jeden nasleduje druhý.

Variácie v konsenzuálnych sekvenciách regiónov -10 a -35 menia spojenie RNA polymerázy do promótorovej oblasti. Mutácia s jednou Bázou tak vedie k zníženiu rýchlosti zväzu polymerázovej RNA do promótorovej oblasti.

Funkcia

Prepisový papier

Tata Box sa zúčastňuje na únii a iniciácii transkripcie. V A. coli, Holoenzým RNA polymeráza sa skladá z piatich podjednotiek a₂βσ. Podjednotka σ spája DNA s dvojitým reťazcom a pohybuje sa hľadajúcim box Tata, čo je signál označený začiatkom génu.

Ako sa vyskytuje transkripcia?

Podjednotka σ RNA polymerázy má veľmi vysokú konštantu spojenia s promótorom (v poradí 10^jedenásť), čo naznačuje vysokú špecifickosť rozpoznávania medzi ňou a sekvencia pribievacieho boxu.

Môže vám slúžiť: Langerhansové bunky: Charakteristiky, morfológia, funkcie

RNA polymeráza sa spája s promótorom a tvorí uzavretý komplex. Potom tvorí otvorený komplex, ktorý sa vyznačuje miestnym otvorom 10 bázových párov dvojitého DNA vrtule DNA. Tento otvor je uľahčený, pretože sekvencia pribiew boxu je bohatá na A-T.

Keď je DNA rozrušená, vytvorí sa prvé fosfodiérové ​​spojenie a začína sa elantácia RNA. Uvoľňuje sa podjednotka σ a RNA polymeráza sa opustí promótor. Ďalšie molekuly RNA polymerázy sa môžu pripojiť k promótorovi a začať transkripciu. Týmto spôsobom je možné gén prepisovať mnohokrát.

V kvasinkách sa RNA polymeráza II skladá z 12 podjednotiek. Tento enzým začína transkripciu rozpoznávajúcu dva typy konsenzuálnych sekvencií na konci začiatku transkripcie, konkrétne: konsenzus TATA; CAAT konsenzuálna sekvencia.

Prepisové faktory

RNA polymeráza II potrebuje proteín, nazývaný transkripčné faktory TFII, aby sa vytvoril aktívny transkripčný komplex. Tieto faktory sú celkom zachované vo všetkých eukaryotoch.

Transkripčné faktory sú proteínové molekuly prírody, ktoré sa môžu spojiť s molekulou DNA a majú schopnosť zvyšovať, znížiť alebo zrušiť produkciu špecifického génu. Táto udalosť je rozhodujúca pre reguláciu génov.

Tvorba transkripčného komplexu začína väzbou proteínu TBP („proteín viažuci sa na Tata“) s Tata CAJA. Tento proteín sa zase viaže TFIIB, ktorý sa tiež viaže na DNA. Komplex TBP-TFIIB sa spája s ďalším komplexom tvorený TFIIF a RNA polymeráza II. Týmto spôsobom TFIIF pomáha RNA polymeráza II pripojiť sa k promótorovi.

Môže vám slúžiť: Lenticela

Nakoniec sa Tfiie a tfiih spoja a vytvorte uzavretý komplex. Tfiih je helosa a podporuje separáciu dvojitého reťazca DNA, čo je proces, ktorý ATP potrebuje. Stáva sa to na začiatku syntézy RNA. Týmto spôsobom sa vytvára otvorený komplex.

Transkripčné faktory a rakovina

Proteín p53 je transkripčný faktor, tiež známy ako proteín supresorov P53 s potlačením nádoru. Je to produkt dominantnej rakoviny. Syndróm Li-Francoi sa vytvára kópiou tohto mutovaného génu, ktorý spôsobuje výskyt karcinómov, leukémie a nádorov.

Je známe, že p53 inhibuje transkripciu niektorých génov a aktivuje ich ostatných. Napríklad p53 zabraňuje transkripcii génov pomocou promótora tata tvorbou komplexu tvoreného p53, inými transkripčnými faktormi a promótorom tata. P53 teda udržuje rast buniek pod kontrolou.

Odkazy

1. Bohinski, r. 1991. Biochémia. Addison-Wesley Iberoamericana, Wilmington, Delaware.
2. Ubytovňa, h., Berk, a., Zipurski, s.L., Matsudaria, P., Baltimore, D., Darnell, J. 2003. Bunková a molekulárna biológia. Pan -American Medical Editorial, Buenos Aires.
3. Priatelia. 1994. P53: pohľad na bábku za tieňovou hrou. Science, 265: 334.
4. Devlin, T.M. 2000. Biochémia. Redakčné Reverté, Barcelona.
5. Voet, D., Voet, J. 2004. Biochémia. Jonh Wiley a Sons, New York.
6. Nelson, D. L., Cox, m. M. 2008. Lehninger-Principles of Biochemistry. W.H. Freeman, New York.